Op het Alberdingk Thijm College wordt iedere leerling zo goed mogelijk begeleid. De vakdocenten geven extra aandacht en hulp als de leerlingen dat nodig hebben. Iedere klas heeft een mentor. In de brugklas zijn er zelfs twee mentoren. Deze mentoren houden de schoolprestaties bij, maar willen ook graag weten hoe het met de leerling gaat. Je levert immers de beste prestaties als je je goed voelt.
Iedere brugklas heeft ook twee mini-mentoren. Dat zijn leerlingen uit de vierde klas, die de brugklassers wegwijs maken op school. Voor leerlingen, die op emotioneel gebied hulp nodig hebben of faalangstig zijn, zijn er op school specialisten aanwezig.